Kongskilde Naturcenter er indrettet i den gamle Kongskilde Vandmølle, som har rødder tilbage til middelalderen. Vandmøllen blev anlagt omkring 1282 af munkene på Sorø Kloster. I møllebygningen findes stadig den turbine, som blev installeret i 1910 for at udnytte vandkraften optimalt. I første halvdel af forrige århundrede fremstillede møllen elektricitet og mel.